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代谢组学数据有望实现共享

  深圳商报讯(记者谢静)5月11日,记者从华大基因获悉,由欧洲生物信息研究所、英国伯明翰大学、英国基因组分析中心、华大基因及其开放式大数据期刊《GigaScience》等组成的合作联盟,获得了英国生物技术和生物科学研究理事会(BBSRC)的基金资助。中英将在代谢组学数据方面开展多方面合作。

  

  代谢组学即采用质谱仪对生物体内的小分子(代谢物)进行检测和量化,再通过计算程序分析,以确定代谢物的丰富性。这些结果将用于评估个体的细胞情况和健康状态。

  

  成立于2012年的MetaboLights平台可以储存和共享这些数据。然而,目前数据共享的步伐还无法跟上代谢组学科学论文的出版速度合作联盟将使用BBSRC资助的3万举办培训班,支持中英科学家管理和共享他们的代谢组学数据和分析。该合作联盟将与Software Carpentry、Data Carpentry、ELIXIR和Galaxy Project这四大致力于计算和生物信息技术。

  

  英国基因组分析中心的Vicky Schneider表示,通过与GigaScience和华大基因合作,目标是重振英国乃至全球的代谢组学数据共享。英国基因组分析中心将在对科学家进行代谢组学数据管理和共享的信息学培训方面发挥重要作用。